As linhas de pesquisa do mestrado, nas quais os docentes orientam, são:
1. Análise Estrutural de Compostos Químicos e Fármacos;
2. Modelagem Molecular;
3. Química Ambiental;
4. Química de Materiais e Polímeros;
5. Síntese de Compostos Químicos e Avaliação Biológica.