O Câmpus Aparecida de Goiânia inaugurou suas atividades em dezembro de 1999, então como Polo Universitário, com a preparação para a primeira seleção de alunos, que foi realizada no início de janeiro do ano 2000. As aulas começaram no dia 17 daquele mês, com o curso de Licenciatura Plena Parcelada Municipal I – Pedagogia.
O Polo foi formado com 218 alunos da rede municipal de educação dos municípios de Aparecida de Goiânia (186 alunos) e Aragoiânia (32 alunos), tendo como sede o Colégio Estadual Buriti Sereno, em Aparecida de Goiânia. Em janeiro de 2001, por meio de um convênio com o governo do Estado, iniciaram-se os cursos de Pedagogia (4 turmas), Matemática (2 turmas) e Letras (3 turmas), aumentando significativamente o número de alunos, que passava de 218 para 650. Em abril do mesmo ano, foi feita a locação do Centro Educacional Sul D'América, na Vila Brasília, em Goiânia, para atender à crescente demanda, com a inserção de novos cursos e atividades, como o Projeto Vaga-Lume - Alfabetização Solidária, o Centro de Idiomas, cursos de Pós-Graduação, bem como a realização de convênios com o Sindicato das Escolas Particulares do Estado de Goiás – SINEPE. Assim, tornou-se iminentemente necessária a transformação do Polo em Unidade Universitária.
No dia 13 de novembro de 2006, o Governador Alcides Rodrigues Filho sancionou a Lei nº 15.804, decretada pela Assembleia Legislativa do Estado de Goiás, que criou onze Unidades Universitárias da UEG, dentre elas a Unidade Universitária de Aparecida de Goiânia, instalada atualmente em sede própria, localizada no Bairro Conde dos Arcos, município de Aparecida de Goiânia.
As “Unidades Universitárias” passaram, então, a ser denominadas “Câmpus”, constituindo-se administrativa e academicamente. A administração em cada Câmpus tem a Congregação como órgão deliberativo e normativo máximo; o Conselho Acadêmico, como órgão técnico de supervisão e deliberação em assuntos de ensino, pesquisa e extensão; e a Diretoria como órgão executivo.
No ano de 2010 foram criados os Cursos de Ciências Contábeis e Administração, e no ano de 2018, o curso de Direito, no Câmpus Aparecida de Goiânia, visando suprir a necessidade de qualificação de mão de obra para atender à demanda do mercado de trabalho da cidade de Aparecida de Goiânia e cidades circunvizinhas.
Atualmente, o Câmpus Aparecida de Goiânia conta com uma pós graduação lato sensu “Gestão de Negócios”.